bioRxiv란 무엇인가? 생물학 프리프린트 완벽 가이드

저는 그동안 medRxiv, OSF Preprints, Preprints.org 등 다양한 프리프린트 플랫폼을 사용해 왔습니다. 최근에는 새로운 오픈 액세스 프리프린트 서버인 bioRxiv를 알게 되었습니다. 다른 플랫폼과 마찬가지로, bioRxiv는 생물학 분야 연구 결과를 빠르게 공유할 수 있는 다양한 기능을 제공합니다. bioRxiv가 무엇인지, 어떻게 작동하는지 잘 모른다면 이 글이 도움이 될 것입니다.

이 블로그에서는 bioRxiv가 무엇인지와 함께, 제가 일상적인 연구 작업에서 어떻게 활용하는지 간단히 소개합니다. 또한 bioRxiv와 UPDF AI 논문 검색 같은 연구 도구를 비교하여 어떤 점에서 더 유용한지 살펴봅니다. 이제 시작해 보겠습니다! 아래 버튼을 클릭하여 UPDF AI 논문 검색 기능을 무료로 체험해 보세요.

파트 1. bioRxiv가 저에게 의미하는 것

bioRxiv는 생물학 및 기타 과학 관련 작업을 위해 만들어진 오픈 액세스 사전 출판 서버입니다. 이 플랫폼에서 연구자들은 다른 과학자들이 공식적으로 검토하고 심사하기 전에 연구 논문을 온라인으로 공유합니다. 제게 bioRxiv는 다양한 주제를 탐색하고, 초기 연구 결과를 찾고, 새로운 질문을 생각해내는 데 가장 좋은 곳 중 하나입니다.

하지만 이 저널은 동료 심사를 거치는 학술지가 아니므로 다른 과학자들이 해당 연구 내용을 완전히 검증하지 않았습니다. 또한 공식 과학 학술지처럼 정기적인 영향력 지수도 없습니다. 따라서 새로운 연구 아이디어를 찾을 수 있는 발견의 장이라고 할 수 있습니다.

저는 이 플랫폼을 오랫동안 테스트해 왔으며, 다양한 주제를 찾는 데 사용한 방법을 알려드리겠습니다. 먼저 bioRxiv 공식 웹사이트에 접속하여  필요한 주제를 찾으세요. bioRxiv를 열면 다음과 같은 옵션이 표시됩니다.

• 검색창
• 검색, 둘러보기, 소개 등의 버튼이 있는 메뉴 바
• 페이지 중앙에 생화학, 암 생물학 등 최근 연구 논문 목록

이제 "검색 상자"를 사용하여 원하는 주제를 찾을 수 있습니다. 아래 이미지와 같이 키워드, 주제 또는 저자 이름을 입력하세요.

키워드를 입력하는 대신 화면에서 "주제"를 클릭할 수도 있습니다. 그러면 신경과학, 유전학 또는 생물정보학 같은 주제를 선택할 수 있습니다.

이제 홈 화면에서 사용할 수 있는 다른 옵션들을 살펴보겠습니다. 예를 들어:

• 제출: 이 옵션을 선택하면 연구 논문을 제출할 수 있습니다. 이 옵션을 클릭하자 "제출하기" 버튼이 있는 새 페이지로 이동했습니다.

해당 옵션을 클릭하자 새 페이지가 열렸고, 이메일과 비밀번호 같은 로그인 정보를 입력하라는 메시지가 나타났습니다. 아래 이미지에서 볼 수 있듯이, 이 페이지에는 작성자 영역, 개인 영역, 제휴 영역과 같은 다른 옵션들도 있습니다.

• FAQ: bioRxiv 사용과 관련하여 자주 묻는 질문에 대한 답변을 여기에서 찾을 수 있습니다.

• 블로그: 이 버튼을 클릭하면 과학 및 bioRxiv 관련 뉴스, 업데이트, 기사들을 볼 수 있습니다. 저는 여기서 흥미로운 과학 관련 주제들을 많이 찾을 수 있었습니다.

• 알림/RSS: 최신 기사, 뉴스 등과 같은 업데이트를 구독할 수 있습니다.

• 자료: 이 플랫폼 사용법을 모르시는 분들을 위해 이 섹션을 준비했습니다. 과학자와 독자 모두에게 유용한 동영상과 도구들이 있습니다. 예를 들어, 저는 논문 제출 지침, 다른 연구 웹사이트 링크, 그리고 다양한 데이터 분석 도구들을 찾을 수 있었습니다.

• 채널:  여기서는 4D 뉴클레옴, 대만 중앙연구원 등과 같은 주제별로 분류된 다양한 논문을 찾아볼 수 있습니다.

파트 2. 제가 계속 궁금했던 영향력 지수 질문

처음에 bioRxiv 영향력 지수를 찾아보려 했을 때 정말 혼란스러웠습니다. 일반적으로 학술지에는 영향력 지수(IF)라는 수치가 있는데, 이는 해당 학술지에 실린 논문이 다른 과학자들에 의해 얼마나 자주 인용되거나 활용되는지를 나타냅니다. 수치가 높을수록 해당 학술지가 더 중요하다고 볼 수 있습니다.

처음에는 bioRxiv도 똑같이 작동할 거라고 생각했는데, 그렇지 않았습니다. 그래서 가장 중요한 질문은 "영향력 지수가 없다면 논문이 중요한지 어떻게 알 수 있을까요 ?" 입니다. 답은 간단합니다. bioRxiv에서는 영향력 지수가 중요하지 않습니다. bioRxiv는 과학자들이 공식 출판 전에 논문의 초기 버전을 공유하는 사전 출판 서버입니다. 정말 중요한 것은 다음과 같습니다.

• 논문의 최종 게재 경로: 과학자들이 bioRxiv에 논문을 게시하면, 그중 상당수가 나중에 공식 학술지에 게재됩니다. 이후 해당 논문들을 확인하여 연구의 신뢰성을 검증할 수 있습니다.
• 논문 인용 횟수: 논문이 bioRxiv에 처음 발표되었더라도 다른 과학자들이 읽고 자신의 연구에 활용하면 그 중요성이 커집니다. 인용 횟수가 많을수록 더 많은 사람들의 관심을 받게 됩니다.

이 플랫폼을 사용하면서 저는 biorxiv 영향력 지수가 중요한 것이 아니라는 것을 알게 되었습니다 . 훨씬 더 중요한 것은 연구의 질과 공식 학술지에 발표된 후 얼마나 많은 다른 과학자들이 그 연구를 활용하는가입니다.

파트 3. 영향력 지수 없이 bioRxiv 논문 품질을 판단하는 방법

앞서 언급했듯이 bioRxiv에는 전통적인 영향력 지수가 없습니다. 저는 연구의 질을 판단하기 위해 다른 요소들을 사용합니다. 하나씩 살펴보겠습니다.

• 저는 저자들의 소속 기관, 즉 그들이 어디에서 일하는지, 그리고 양질의 연구 논문을 발표했는지 여부를 확인합니다. 또한 그들의 대학 출신과 경력도 잊지 말고 확인합니다.
• 저는 논문에 연구 방법이 완벽하게 기술되어 있는지 여부도 살펴봅니다. 좋은 사전 공개 논문은 보통 연구 방법이 명확하고 연구가 단계별로 어떻게 진행되었는지 설명합니다.
• bioRxiv에서 저는 이전 연구뿐만 아니라 업데이트된 사전 공개 버전과 데이터 공유 시점도 확인합니다. 이는 저자들이 연구를 개선하고 있는지 여부를 파악하는 데 중요한 지표입니다.
• 제가 또 하나 눈여겨보는 것은 커뮤니티의 반응입니다. 논문 아래에 댓글이나 토론이 있다면, 다른 과학자들이 그 논문을 읽고 생각하고 있다는 뜻이니까요.
• 마지막으로 제가 확인한 것은 해당 논문이 발표된 학술지의 영향력 지수였습니다. 영향력 지수가 높다는 것은 사람들이 그 주제에 관심이 많다는 것을 의미합니다.

bioRxiv에서 저널을 선택하기 전에 고려해야 할 몇 가지 중요한 요소가 있습니다. 하지만 사전 공개 논문은 아직 완벽한 검증이 이루어지지 않았으므로 주의 깊게 읽어야 합니다. 의학적 또는 임상적 주장과 같은 중요한 주제의 경우, 가능하다면 동료 검토를 거친 최종 논문과 사전 공개 논문을 대조하여 확인하는 것이 좋습니다.

파트 4. 저의 이중 연구 지원 도구

최신 연구 동향을 파악하려면 적절한 연구 도구를 선택하는 것이 중요합니다. 저는 생물학 분야의 최신 연구 결과를 얻기 위해 bioRxiv를 주로 이용합니다. 이 플랫폼을 통해 논문이 정식으로 출판되기 전에 미리 확인할 수 있기 때문입니다.

반면에 UPDF AI Paper Search는 저의 똑똑한 연구 도우미 역할을 합니다. 저는 이 도구를 사용하여 연구 관련 질문을 하고, 관련 키워드를 찾고, 논문의 풍부한 메타데이터를 확인하는 등 다양한 작업을 합니다. 이제 이 소프트웨어의 주요 기능에 대해 알아보겠습니다.

1. 두 가지 논문 검색 모드:

대시보드에는 딥씽크와 키워드라는 두 가지 옵션이 있습니다. 딥씽크 옵션을 사용하면 연구 질문을 직접 입력할 수 있습니다. 반면, 키워드 옵션은 관련 논문을 찾는 데 도움이 됩니다.

2. 2억 2천만 건 이상의 학술 논문:

간단한 키워드, 논문 제목 또는 DOI나 PMID와 같은 특수 코드를 입력하여 2억 2천만 건이 넘는 연구 논문을 쉽게 검색할 수 있습니다.

3. 메타데이터:

각 논문에 대한 상세 정보와 메타데이터, 간략한 요약을 빠르게 확인할 수 있으므로 논문의 내용을 신속하게 파악하고 자신에게 유용한지 여부를 판단할 수 있습니다.

4. 다양한 필터를 사용하기:

"필터" 아이콘을 클릭하여 연도, 연구 분야, 공개 PDF 등 다양한 기준으로 검색 결과를 좁힐 수 있습니다. 또한 인용 그래프를 사용하여 논문 간의 연결 관계를 파악하고 가장 관련성이 높은 연구에 집중할 수 있습니다.

5. 친구 추가, 보기 및 채팅:

논문을 찾으면 라이브러리에 추가하여 체계적으로 관리할 수 있습니다. 또한 채팅에 논문을 추가하고 관계도를 통해 다양한 연구 간의 연결 관계를 확인할 수 있습니다. 더 나아가, PDF 채팅 버튼을 사용하여 논문에 대한 심층적인 질문을 할 수 있습니다.

6. PDF 다운로드 :

정면 비교

항목	bioRxiv	UPDF AI 논문 검색
핵심 중점	오픈 소스 플랫폼, 생물학 분야 사전 인쇄본 무료 접근 및 공유	AI를 사용하여 학술 문헌과 관련된 모든 주제 검색
검색 및 발견	키워드 및 제목 검색, 기본 필터(예: 주제 영역, 날짜)	키워드 / 논문 제목 / DOI / PMID 조회, 필터(날짜, 오픈 액세스), TLDR 및 인용 네트워크
품질 신호	저자 기록; 이후 학술지 게재는 간접적인 bioRxiv 저널 영향력 참고	AI 요약, 인용 횟수, 관계 그래프; 동료 검토 논문과 사전 인쇄본 모두 처리
문서 상호작용	전체 사전 인쇄본 PDF 바로 보기 및 다운로드, 가능한 경우 참고 문헌과 링크 표시	PDF 보기 및 다운로드(가능 시), 개별 논문 요약 확인, PDF와 대화하며 질문, 라이브러리에 저장
비용	모든 사전 인쇄본과 메타데이터 제출, 검색, 열람, 다운로드 무료, 구독 불필요	무료 등급(100회 프롬프트) 사용 제한, 연구량 많을 경우 유료 옵션 제공

결론

사전 공개 논문을 읽거나 제출하고 싶다면 bioRxiv가 좋은 선택입니다. 무료로 이용할 수 있고, 학술지에 게재되기 전에 새로운 연구 결과를 확인할 수 있기 때문입니다. 과학자들은 이 플랫폼을 통해 연구 결과를 공유합니다. 다만, bioRxiv 자체에는 영향력 지수가 없으므로, 논문이 다른 플랫폼에 게재된 후 해당 학술지의 영향력 지수를 확인해야 합니다.

작업을 더 쉽게 하려면 UPDF AI 논문 검색을 사용해 보시길 추천합니다. 몇 초 만에 논문을 찾을 수 있도록 도와줍니다. 네, 맞습니다. 논문을 쉽게 찾고,  요약을 확인하고 , 관계 그래프를 통해 논문 간의 연결 관계를 탐색하는 등 다양한 기능을 활용할 수 있습니다. 그 외에도 PDF와 채팅하고, UPDF AI 심층 연구 기능을 사용하여 문헌 검토를 작성하는 등 여러 가지 유용한 기능을 제공합니다.